Ο Ε.Ο.Σ. Σάμου έχει βασικό σκοπό την οικονομική και κοινωνική πρόοδο των αμπελοκαλλιεργητών - μελών του και της Σαμιακής κοινωνίας γενικότερα. Κύριες στοχεύσεις του αποτελούν η διατήρηση της αμπελουργίας, η ταύτιση του συνεταιριστικού σχήματος με προϊόντα και υπηρεσίες υψηλής και σταθερής ποιότητας, η ισχυροποίηση της αναγνωρισιμότητας των προϊόντων, η διαρκής ποιοτική αναβάθμισή τους, αλλά και η δημιουργία νέων προϊόντων, που να ανταποκρίνονται στις σύγχρονες επιλογές του καταναλωτή. Ακόμη, η αύξηση του μεριδίου των σαμιακών οίνων στην παγκόσμια αγορά οίνου και η διαρκής επέκταση σε νέες αγορές.
